В Московском зоотехническом институте коневодства проводилось обучение в аспирантуре. В 1954 г. в Ижевск переехали аспиранты Соколов В.В., Гусев А.Н. Их научным руководителем был профессор, доктор сельскохозяйственных наук Меньшов Б.Г.

С открытием агрономического факультета и факультета механизации сельского хозяйства в Ижевском СХИ началась подготовка научнопедагогических кадров. Некоторые аспиранты тех лет позднее стали докторами сельскохозяйственных наук, заслуженными деятелями науки Удмуртской Республики – Соколов В.В., Ижболдина С.Н., Башков А.С., Холзаков В.М. В середине 60-х годов прошлого столетия в Ижевском СХИ аспирантура была ликвидирована.

Во исполнение Постановления Министерства науки, высшей школы и технической политики Российской Федерации № 57 от 05.04.1993 г. «Об организации аспирантуры при высших учебных заведениях и научноисследовательских учреждениях Российской Федерации» с 22.10.1993 г. в Ижевском сельскохозяйственном институте создан отдел аспирантуры. Подготовка аспирантов была разрешена по 10 научным специальностям:
01.02.06 – Динамика, прочность машин, приборов и аппаратуры;
05.20.02 – Электрификация сельскохозяйственного производства;
05.20.03 – Эксплуатация, восстановление и ремонт сельскохозяйственной техники;
06.01.03 – Агропочвоведение и агрофизика;
06.01.09 - Растениеводство;
06.01.11 – Защита растений;
06.02.01 – Разведение, селекция и воспроизводство сельскохозяйственных животных;
06.02.04 – Частная зоотехния, технология производства продуктов животноводства;
08.00.05 – Экономика и управление народным хозяйством;
16.00.04 – Ветеринарная фармакология с токсикологией.

Первый приём в аспирантуру был проведён 1 декабря 1993 г.: 7 чел. на очное обучение и 4 чел. на заочное обучение. С аспирантами и соискателями первого набора научное руководство осуществляли 4 доктора наук и 11 кандидатов наук. Среди них доктора наук - Ижболдина С.Н., Соколов В.В., Шишкин М.И., Ковриго В.П.; кандидаты наук – Трикоз Р.С., Алборов Р.А., Захаров В.В., Ленточки А.М., Фатыхов И.Ш., Зонов Б.Д., Большаков В.И., Широбоков В.И., Скурыгин И.Н., Шмигель В.Н., Хромченков В.Д. Отсутствие научных школ, невыполнение контрольных цифр приёма в аспирантуру в этот период обусловило единичные защиты только кандидатских диссертаций. В 1996 г. состоялся первый выпуск аспирантов – 1 чел., Зорин А.А., который закончив обучение в аспирантуре, защитил диссертацию.

За период 2003 – 2011 гг. в аспирантуре академии были открыты 8 научных специальностей:
1). 06.01.01 – Общее земледелие;
2). 06.01.04 – Агрохимия;
3). 06.01.05 – Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений;
4). 06.02.01 – Диагностика болезней и терапия животных, патология, онкология и морфология животных;
5). 06.02.08 – Кормопроизводство, кормление сельскохозяйственных животных и технология кормов;
6). 06.03.01 – Лесные культуры, селекция, семеноводство;
7). 06.03.02 – Лесоведение, лесоводство, лесоустройство и лесная таксация;
8). 06.03.03 – Агролесомелиорация, защитное лесоразведение и озеленение населённых пунктов, лесные пожары и борьба с ними.

В настоящее время академия осуществляет подготовку научнопедагогических и научных кадров высшей квалификации через аспирантуру и соискательство на 40 кафедрах академии. Приём и подготовка аспирантов проходит по 17 научным специальностям.

За период 1993 - 2012 гг. сотрудниками, аспирантами и соискателями академии защищено 318 диссертаций на соискание учёной степени кандидата наук и 31 диссертация на соискание ученой степени доктора наук. В течение 1993 - 2000 гг. аспирантуру окончили 54 чел., из них только 9 аспирантов успешно в срок выполнили индивидуальный план подготовки, защитили научные работы в диссертационных советах. За данный период аспиранты и соискатели получили 109 удостоверений о сдаче кандидатских экзаменов. За период 2001 – 2012 гг. аспирантуру закончили 217 чел., из которых 126 чел. успешно защитили кандидатские диссертации до окончания срока обучения в аспирантуре и было выдано 336 шт. удостоверений о сдаче кандидатских экзаменов.

В соответствии с приказом Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки (Рособрнадзор) № 526 от 27 апреля 2012 г. академия признана аккредитованным образовательным учреждением, прошедшим государственную аккредитацию по 17 научным специальностям, или по 5 укрупнённым группам специальностей подготовки аспирантов по 3 отраслям наук. Все факультеты нашей академии имеют возможность проводить послевузовское профессиональное обучение в аспирантуре по очной и заочной формам. Для создания благоприятных условий при выполнении докторских диссертаций в академии практикуется перевод преподавателей на должности научных сотрудников и предоставление творческого отпуска, что даёт возможность 100 % защиты соискателей.
Научное руководство аспирантами осуществляют 70 сотрудников академии, из них 32 – доктора наук и 38 - кандидатов наук. Эффективность работы аспирантуры академии на протяжении 10 лет находится на уровне 58 – 87 % от количества закончивших обучение в аспирантуре. Этому способствуют сложившиеся крупные научные школы под руководством профессоров М.И. Шишкина (подготовил 45 кандидатских диссертаций), Р.А. Алборова (подготовил 32 кандидатские диссертации), И.Ш. Фатыхова (подготовил 22 кандидатские диссертации), В.В. Касаткина (подготовил 17 кандидатских диссертаций), С.Н. Ижболдиной (подготовила 14 кандидатских диссертаций), А.И. Любимова (подготовил 11 кандидатских диссертаций и 2 докторские диссертации) и других учёных академии. Общий контингент аспирантов на 01.01.2013 г. составляет 151 чел., из них 72 чел. - очной формы обучения, 79 чел. – заочной формы обучения; 3 чел. оформлено в качестве соискателей ученой степени кандидата наук для подготовки диссертаций.

Комиссия из высококвалифицированных научно-педагогических и научных кадров на кафедре философии (2 доктора философских наук, 2 кандидата философских наук) и на кафедре иностранного языка (5 кандидатов филологических наук) правомочна принимать кандидатские экзамены по соответствующим обязательным дисциплинам (История и философия науки; иностранный язык) всех научных специальностей в аспирантуре академии.